Tja, ich hab ein ähnliches Problem, mit dem Unterschied dass er nur auf Benzin auf 3 Pötten läuft...und das auch nur manchmal. Ich habe das komplette Einspritzrail samt Düsen und Druckregler erneuert ohne Erfolg.
Ich vermute den Fehler beim Gassteuergerät, es schaltet irgendwie einen Zylinder manchmal nicht sauber auf Benzin. Schalte ich um auf Gas, läuft der Motor sofort sauber.
Es kann theoretisch auch bei Dir am Gassteuergerät liegen. Um das rauszubekommen solltest du messen ob die Einspritzdüsen alle angesteuert werden.